ABSTRACT Cacao fruits are agronomically important and show wide variability for several morphological descriptors. The present study aimed to characterize the genetic distance of 51 genotypes of Theobroma cacao L. in the cocoa-producing region of Southern Bahia (Brazil) based on morpho-agronomic descriptors. The inference of genetic similarity was performed from the phenotypic data derived simultaneously from qualitative and quantitative variables, using the Ward-MLM procedure (Modified Location Model) with the SAS® software. The distance matrix was obtained using the Gower logarithmic function. For this, 28 descriptors were evaluated, five qualitative and 23 quantitative. Furthermore, using the likelihood function procedure, the optimal number of groups was five indicating wide variability. Of 23 quantitative descriptors evaluated by fruits and leaves, 95% showed significant differences. The exception was seed width. Groups 1 and 5 were the most distant, while groups 2, 3, and 4 were closest to each other. The greatest difference between increments was 35.32 for the fifth group. The analysis of the first two canonical axes revealed that both represented 81.88% of the variation, with CAN1 and CAN2 responsible for 53.66% and 28.22% of the variation. The most promising genotypes for breeding programs belong to group 5 due to their superior performance for almost all characteristics analyzed.

RESUMO Os frutos de cacau são de grande importância agronômica e apresentam ampla variabilidade em vários descritores morfológicos. O presente estudo teve como objetivo caracterizar a distância genética de 51 genótipos de Theobroma cacao L. na região produtora de cacau do Sul da Bahia (Brasil) com base em descritores morfo-agronômicos. A inferência de similaridade genética foi realizada a partir dos dados fenotípicos derivados simultaneamente de variáveis qualitativas e quantitativas, utilizando o procedimento Ward-MLM (Modified Location Model) com o software SAS®. A matriz de distância foi obtida utilizando a função logarítmica de Gower. Para isso, 28 descritores foram avaliados, cinco qualitativos e 23 quantitativos. Além disso, usando o procedimento de função de verossimilhança, o número ótimo de grupos foi cinco, indicando ampla variabilidade. Dos 23 descritores quantitativos avaliados em frutos e folhas, 95% apresentaram diferenças significativas, exceto a largura da semente. Os grupos 1 e 5 foram os mais distantes, enquanto os grupos 2, 3 e 4 foram mais próximos. A maior diferença entre os incrementos foi de 35,32 para o quinto grupo. A análise das duas primeiras variáveis canônicas representou um total de 81,88% da informação para a distribuição da variação, com CAN1 responsável por 53,66% e CAN2 por 28,22% da variação. Os genótipos mais promissores para programas de melhoramento pertencem ao grupo 5 devido ao seu desempenho superior para quase todas as características analisadas.

Resumo O objetivo deste estudo foi otimizar e estabelecer um protocolo visando elevar a qualidade e quantidade do ácido desoxirribonucleico (DNA) extraído de folhas, em diferentes estágios de desenvolvimento e conservação, coletadas em plantas adultas e plantas jovens. Além disso, almejou-se padronizar a amplificação via reação de polimerase em cadeia (PCR) e selecionar os marcadores de inter sequência simples repetida (ISSR) de Elaeis guineensis (dendezeiro). O protocolo brometo de cetiltrimetilamônio (CTAB) modificado, devido à suplementação com betamercapto etanol (0,3%) e polivinilpirrolidone (PVP) (3%) no tampão de extração e CTAB 10% com 1,4 M de NaCl a 20 min de incubação, a 650C, resultou em melhorias qualitativas e quantitativas na extração do DNA, mas com variações entre amostras, provavelmente, devido às variações na degradação e estágio de desenvolvimento das folhas. Foram utilizados dois protocolos de PCR (I e II) para a amplificação do DNA, os quais diferiram principalmente com relação à presença de albumina de soro bovino (BSA) e concentração de primer. Não foi realizada a correlação entre amplificação via PCR e qualidade de DNA, obtidos de folhas danificadas ou sadias, mas se observou que a adição de BSA (0,075 mg/mL) e o aumento na concentração de primer (0,5 pcmol) (protocolo II) resultou em bandas mais intensas e distinguíveis, porém se ressalta que a qualidade do DNA foi essencial para uma boa amplificação, considerando-se todas as amostras. A amplificação do DNA com o protocolo II possibilitou a seleção de cinco primers: UBC 807, 810, 812, 834 e 848; os quais foram utilizados para a amplificação de13 famílias, compostas de uma planta parental e oito progênies cada.

Abstract The objective of this study was to optimize and establish a protocol to enhance the quality and quantity of deoxyribonucleic acid (DNA) extracted from leaves under different development stages and conservation conditions collected from mature plants and seedlings. Furthermore, we aimed to standardize the polymerase chain reaction (PCR) and select an inter simple sequence repeat (ISSR) marker for Elaeis guineensis (oil palm). The modified cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) protocol, which used β-mercaptoethanol (0.3%) and polyvinylpyrrolidone (PVP 3%) supplementation in the extraction buffer and 10 % CTAB with 1.4 M NaCl for a 20-min incubation at 65ºC, resulted in improved DNA quality and quantity. However, this protocol presented variable results among samples, probably due to variations in leaf degradation levels and development stages. The two PCR protocols (I and II) for amplifying the DNA, differed mainly in the presence or absence of bovine serum albumin (BSA) and primer concentration. Although, a correlation between PCR amplification and the quality of the DNA extracted from leaves was not established, the addition of BSA (0.075 mg/mL) and the highest primer concentration (0.5 pmol) (protocol II) resulted in more intense and distinguishable bands on gel electrophoresis. DNA quality was essential for a satisfying amplification, considering all the samples. The use of protocol II allowed the selection of five primers: UBC 807, 810, 812, 834, and 848; these were used in the amplification of the DNA extracted from 13 families consisting of one parental plant and eight progenies each.

Abstract The present study was performed for the morphological and cytogenetic description of F1 hybrids obtained from a cross between Passiflora coccinea Aubl. and Passiflora hatschbachii Cervi. Hybridization was confirmed by genomic in situ hybridization (GISH). Corona banding was the most relevant floral descriptor for separating the hybrids into two groups, the cultivars P. 'Vivis' and P. 'Jhovi', and the parents and hybrids had diploid chromosome number 2n = 18. The F1 progenies exhibited normal meiotic behavior with normal tetrad production, which guaranteed high pollen viability (>70%) and fertile hybrids. Therefore, P. 'Vivis' and P. 'Jhovi' have the potential to be used for ornamental plants market.

Resumo No meloeiro (Cucumis melo), a resistência ao Cucumber mosaic virus (CMV) e o conhecimento sobre características reprodutivas são importantes para escolha de genitores de populações de melhoramento. Desta forma, objetivou-se verificar se diferentes acessos de meloeiro em um banco de germoplasma brasileiro possuem resistência ao CMV (estirpe FNY) e polimorfismo, em locos marcadores de resistência, bem como se há diversidade genética quanto à resistência e aos descritores florais e reprodutivos, visando ao melhoramento genético. Os sintomas ocasionados por CMV foram avaliados em 52 genótipos de meloeiro, os quais foram genotipados com três marcadores de polimorfismos de nucleotídeos únicos, relacionados com resistência ao CMV. Uma amostra de 24 genótipos foi caracterizada quanto a descritores florais e reprodutivos. A variação significativa nos níveis de resistência possibilitou classificar os acessos em cinco grupos. Os polimorfismos detectados por meio dos marcadores distribuíram-se de forma independente nesses grupos, consistente com a natureza quantitativa oligogênica da resistência. Houve diferenças significativas entre acessos nos descritores florais e reprodutivos. Por meio da estratégia multivariada Ward-MLM, esses acessos distribuíram-se em sete grupos com características reprodutivas distintas, incluindo-se variabilidade em viabilidade polínica. Portanto, há acessos brasileiros de meloeiro que possuem resistência ao CMV, bem como variabilidade nas características reprodutivas.

Abstract In melon (Cucumis melo) the resistance to Cucumber Mosaic Virus (CMV) and the knowledge about reproductive characteristics are important for selection of genitors for breeding population. So, the objective was to investigate if different accessions of melon from a Brazilian germplasm bank have variability in resistance to CMV (FNY strain) and polymorphism in resistance loci markers, as well as whether there is genetic diversity on resistance and floral morphology descriptors and reproductive biology, aiming at genetic improvement. The symptoms induced by CMV were evaluated in 52 melon genotypes which were genotyped with three markers of single nucleotide polymorphisms related to CMV resistance. A sample of 24 genotypes was characterized for floral and reproductive descriptors. The significant variation in resistance levels allows classifying the accessions in five groups. The polymorphisms detected by the markers were independently distributed in these groups, consistent with the oligogenic quantitative expression of the melon’s resistance. There were significant differences between accessions in floral and reproductive descriptors. Through the Ward-MLM multivariate strategy, these accesses were distributed into seven groups with distinct reproductive characteristics, including variability in pollen viability. Therefore, there are Brazilian accessions of melon that have resistance to CMV, as well as variability in reproductive characteristics.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética intra e interespecífica de acessos de Manihot por meio de marcadores ISSR. Foram analisadas cinco espécies e duas variedades de Manihot, além de duas espécies do gênero Croton, utilizadas como grupo externo, por meio de 20 oligonucleotídeos iniciadores (Olii) ISSR UBC. Para análise do índice de similaridade entre as espécies e os acessos foram utilizados os coeficientes de Jaccard e de 'simple matching'. Os 20 Olii testados foram altamente polimórficos para todas as espécies analisadas, e 89,7% dos locus foram polimórficos. Há maior similaridade genética entre espécies diferentes de Manihot, como M. dichotoma var. undulata e M. caerulescens, do que entre indivíduos da mesma espécie, como M. dichotoma e M. dichotoma var. undulata.

The objective of this work was to evaluate the genetic diversity within and among accessions of Manihot by using ISSR markers. Five species and two varieties of Manihot, besides two species of the genus Croton, used as the out‑group, were analyzed by using 20 oligonucleotide (Olii) ISSR UBC primers. To analyze the similarity index between species and accessions, the Jaccard and simple matching coefficients were used. The 20 Olii tested were highly polymorphic in all species analyzed, and 89.7% of the loci were polymorphic. A higher genetic variability is observed among different species of Manihot, such as M. dichotoma var. undulata and M. caerulescens, than among individuals of the same species, such as M. dichotoma and M. dichotoma var. undulata.